1、严格意义来讲无良性可言：关于如何判定间质瘤的良、恶性，在临床上仍然是值得争议的问题。但现在更多的学者赞同，对间质瘤不再需要区分良恶性，仅根据肿瘤大小和核分裂像判断肿瘤的危险度，一般认为直径>5厘米者多为恶性。 2、早期症状不明显，易发生转移：胃间质瘤的临床表现差异较大，通常无特殊症状，一般只有当肿瘤较大时才出现症状，如心绞痛、腹部肿块、恶心、体重下降，第一次就诊时约有11%～47%已有转移。40%以上的患者由于肿瘤破裂急性出血，同时出现转移。 3、由于特殊生理特性及结构使得手术治疗效果差：通常，手术是胃间质瘤的首选治疗方式，但是与其他软组织肉瘤相比，胃间质瘤具有很脆的假囊，术中易造成肿瘤破溃继发腹腔内播散，故切除过程已发生癌细胞转移。 4、间质瘤“顽固不化”对传统放化疗不敏感：胃间质瘤临床症状不明显又无特异性。治疗中该病也表现出“顽固不化”的一面，对放化疗均不敏感，又易被误诊为平滑肌瘤或平滑肌肉瘤，很多患者应用大剂量的放化疗，结果不仅无效还浪费金钱、摧残身体。