形成肝内钙化灶的病变很多，包括：①肝内胆管结石，是最常见的因素；②肝内慢性炎症或创伤；③寄生虫感染；④肝脏良恶性肿瘤和肝内转移瘤钙化；⑤先天发育形成，子宫内的胎儿有肝内钙化灶形成，常合并先天畸形，发现率为0.057%。