直接破坏并清除尖锐湿疣组织，可采用外用药物治疗或采用冷冻、激光、微波、光动力治疗等。反复用药等涂擦尖锐湿疣损害和损伤其表皮，使表皮内的人类乳头瘤病毒（HPV）抗原暴露于真皮内的免疫系统，从而建立和发挥完整的免疫功能，以清除疣组织。提高患者全身性和局部性免疫力，提高患者机体抗HPV感染的能力，所采用的方法是全身性或局部性免疫疗法等内用药物疗法。总之，目前治疗尖锐湿疣仍以外用疗法直接去除尖锐湿疣损害为主要治疗方法，其他疗法为辅助治疗方法。