生殖器疱疹的传染源是患者及亚临床无症状的带病毒者，尤其是在患者的生殖器皮肤或粘膜的疱疹内含有单纯疱疹病毒，可通过性接触而传染给配偶或其他性侣，也在同性恋者中互相传染。少数可通过日常生活用品如内裤、浴盆、浴巾等传染。