怀孕三个月可以流产，流产主要是药物流产和手术流产，建议您根据自己的情况选择，如果怀孕49天内，其他检查结果正常，可以选择药物流产终止妊娠，但需要注意定期到医院复查，如果流产不完全需要采取子宫治疗。如果前妊娠超过49天，且符合手术指征，则可采用负压吸引或钳刮等方式终止妊娠。