怀孕三个月不能做无痛人流，因为怀孕月份太大，错过了做无痛人流的较佳时机。如果你怀孕三个月，如果你不想，你只能去医院选择引产手术。具体手术方法可采用药物流产、球囊或羊膜腔引产的检查结果来确定。但引产手术相对于无痛人流的创伤必须更大，在引产前需要到当地计划生育委员会出具引产证明，引产过程可能会产生非常严重的并发症，如子宫穿孔或羊水栓塞，所以手术前必须考虑。