怀孕三个月，如果不打算继续怀孕，一般需要流产终止妊娠，因为在怀孕阶段，胎儿已经发育，错过了直接流产手术的时间，所以需要住院，住院可以选择钳刮手术或选择药物流产和清宫终止妊娠，因为流产毕竟是一种人为因素，也是一种手术创伤，因此就有可能会影响到以后的怀孕，所以建议较好是到正规的医院终止妊娠，同时也需要注意休息，应用抗生素预防感染。