怀孕40天的时候能不能做人流，需要根据孕妇的实际情况而定，不能一概而论。孕妇可以先到医院去做超声检查，确定妊娠囊所在的具体部位，测量妊娠囊的大小，检查凝血功能。经检查后确诊是宫腔内妊娠，并且妊娠囊的直径在1.0厘米以上，凝血功能正常时可以考虑进行人工流产手术终止妊娠。如果经检查后属于宫外孕就不能进行普通的人工流产；虽然确诊是宫内妊娠，但是妊娠囊体积过小，则需要推迟手术的时间。如果孕妇的凝血功能障碍，也不适合做人工流产。