输卵管通液的副作用是存在的：如果采取全麻麻醉下进行通液，就很容易出现恶心和呕吐、困倦、暂时无法小便、喉咙痛、头痛等；以及一些较轻微的副作用，如肌肉疼痛、牙齿、假牙使嘴唇、舌头受伤、暂时性呼吸困难、说话困难以及神经受损；或者并发严重的心脏病、中风、严重过敏反应、脑部/肺部受损、肾/肝衰竭、永久性神经受损、眼部受伤、喉头受损和肺炎等。