黄体功能不全的原因主要是由于促卵泡生长激素和促黄体生长激素分泌失调，使卵泡发育不良和黄体形成缺陷，从而使排卵后黄体分泌孕酮不足，其原因可涉及下丘脑-垂体-卵巢轴各个环节，以及影响该轴功能的诸多原因，从而造成黄体功能不全。